- Pengenalan
- Pengurusan Tertinggi
- Bahagian / Unit
- Institut Penyelidikan Perikanan
- Bahagian Kejuruteraan
- Bahagian Biosekuriti Perikanan
- Bahagian Konservasi & Perlindungan Perikanan
- Bahagian Dasar & Perancangan Strategik
- Bahagian Sumber Perikanan Tangkapan
- Bahagian Akuakultur
- Bahagian Pengembangan Perikanan
- Bahagian Pembangunan Modal Insan
- Bahagian Khidmat Pengurusan
- Bahagian Pengurusan Maklumat
- Pejabat Undang-Undang
- Unit Integriti
- Unit Komunikasi Korporat
